La Escritura Zapoteca tiene una larga historia. En la antigüedad se desarrolló un sistema complejo y avanzado de escritura cuyos vestigios se conservan en Monte Albán y otros sitios arqueológicos zapotecos. Con la llegada de los españoles se interrumpió la Escritura Zapoteca, pero no la escritura del Zapoteco, pues en la época colonial se elaboraron muchos documentos oficiales en este idioma. Después, en el México independiente se dejó de escribir, oficialmente, la lengua zapoteca; pero se retomó en el Siglo XX y se sigue impulsando en la actualidad.
